戦国期の矢野城主は代々三好氏に仕えてきた矢野駿河守国方とされる。天正7（1579）年に脇城外の合戦において長宗我部に敗れ討死している。

『城跡記』によると、矢野城は天正10（1582）年に落城したとされるが、駿河守が戦死したのちは廃城に近い状態だったと推測される。

城跡は徳島市国府町の気延山から東方に派生する標高30ｍの丘陵尾根の先端部に位置する。現在、主郭には城主を祀った城山神社があるほかは山林化している。

尾根の北側斜面の段々畑は戦後に開墾されたものだが、遺構の保存状況は比較的良いと考えられている。居館の位置については不明である。